PLoS Pathog：数据分析揭示宫颈微生物组在HR-HPV自然发展中的作用

人瘤病毒（HPV）病毒感染是最少见的性传播疾病之一。然而，只有一小部分高危（HR）HPV病毒感染成效为卵巢癌前病变和癌症。在这项数据分析之前，我们深入调查了卵巢化学物质三组（CVM）在HR-HPV自然文化史之前的抑制作用，数据分析结果已在线登载于PLoS Pathog。

数据分析扩展到18-25岁的异性恋，用于两次求诊的HR-HPV病毒感染异性恋（n = 273名异性恋）的卵巢样本审核CVM对HR-HPV自然文化史之前的革命性抑制作用。尤其非议病毒感染清除、持续和成效到卵巢上皮内瘤变2级和3级（CIN2+）。用于Illumina MiSeq平台对细杆菌16S V4 rRNA遗传区域内和真杆菌ITS1区域内进行时扩增和DNA，对CVM进行时连续性。用于QIIME2进行时OTU聚类。用于PICRUSt推算功能三组，并用于R进行时统计数据分析。

结果，在第1会面时（V1），乳酸杆杆菌iners的总质量与HR-HPV病毒感染的清除有关（一维判别数据分析（LDA）>4.0），而V1托马斯杆菌是HR-HPV成效的主要生命体；也（LDA>4.0）。在第2会面时（V2）时，化学物质香农自然的上升与CIN2+的成效显著系统性（P = 0.027）。多变量之前介数据分析说明了，V1托马斯杆菌与CIN2+成效的仍要系统性是由于V2时卵巢自然上升引致（p = 0.040）。CVM最重要糖类的全多变量模型说明了，通过V1营养糖类属，OR = 0.41（0.22-0.79）、V1真杆菌自然，OR = 0.90（0.82-1.00）和V1连续性细胞爱国运动途径，OR = 0.75（0.62-0.92）具有显著的保护抑制作用，而V2细杆菌自然，OR = 1.19（1.03-1.38）则对CIN2+的成效具有数据分析抑制作用。

综上所述，该数据分析推断，在此革命性斜向队列之前，卵巢化学物质三组的特性与HR-HPV成效系统性。推断，托马斯杆菌和成效到CIN2+的相似之处无论如何可能是由随后化学物质自然的提升所内源性的。与HR-HPV成效系统性的化学物质三组特性可能是卫生保健CIN2+的治疗性操作方法的要能。

原始来历：

Mykhaylo Usyk, Christine P Zolnik, et al., Cervicovaginal microbiome and natural history of HPV in a longitudinal study. PLoS Pathog. 2020 Mar 26;16(3):e1008376. doi: 10.1371/journal.ppat.1008376.